植(zhi)物原位雜交在遺傳育種方面的(de)應用(yong)主要包(bao)括(kuo)：

異源染(ran)色(se)(se)質(zhi)(zhi)及多種(zhong)(zhong)染(ran)色(se)(se)體(ti)畸(ji)變檢測(ce)：通過遠(yuan)緣雜交把有(you)用(yong)遺傳物(wu)質(zhi)(zhi)基因的異源染(ran)色(se)(se)質(zhi)(zhi)漸滲到(dao)植物(wu)中。如(ru)帶有(you)幾種(zhong)(zhong)抗病基因的黑(hei)麥(mai)1R染(ran)色(se)(se)體(ti)已被整合到(dao)許(xu)多高產的小麥(mai)品(pin)種(zhong)(zhong)中。原位雜交技術則是鑒定外源染(ran)色(se)(se)體(ti)(質(zhi)(zhi))的有(you)效(xiao)手(shou)段。

基因組印記研究：基因組印記是指一個基因的兩條染色體上的DNA序列存在差異。通過植物原位雜交技術，可以檢測到基因組印記的存在和分布，從而幫助確定基因組的進化、遺傳和功能特征。

植物(wu)染(ran)(ran)色體(ti)原位(wei)雜(za)交(jiao)(jiao)是一種重要的分子生物(wu)學(xue)技術(shu)，原位(wei)雜(za)交(jiao)(jiao)檢測，它(ta)可以用來(lai)研(yan)究(jiu)植物(wu)基因組的結(jie)構和功能。該技術(shu)利用DNA探針(zhen)與目標(biao)DNA序列(lie)的互(hu)補性(xing)(xing)結(jie)合，染(ran)(ran)色體(ti)原位(wei)雜(za)交(jiao)(jiao)，通過(guo)熒光或(huo)性(xing)(xing)標(biao)記來(lai)檢測目標(biao)DNA序列(lie)在(zai)染(ran)(ran)色體(ti)上的位(wei)置和數量。

植(zhi)物染色體原(yuan)位雜(za)交技術(shu)的基本(ben)原(yuan)理是將DNA探(tan)針(zhen)標(biao)記上熒光或(huo)性同位素，然(ran)后將其與(yu)目(mu)(mu)標(biao)DNA序列進行雜(za)交。在雜(za)交過(guo)程中(zhong)，探(tan)針(zhen)與(yu)目(mu)(mu)標(biao)DNA序列互補(bu)結合，形(xing)成穩定的雙鏈DNA分子。隨后，通過(guo)熒光或(huo)性同位素探(tan)測技術(shu)，可以檢測到(dao)目(mu)(mu)標(biao)DNA序列在染色體上的位置(zhi)和數量(liang)。

將32 P標記的雙鏈DNA探針于100℃加熱5分鐘(zhong)，湖北原位(wei)雜交，迅速置于冰浴(yu)中(zhong)。單(dan)鏈探針不必(bi)變性(xing)。將探針加到雜交袋中(zhong)雜交過夜(ye)。雜交期間，盛濾膜(mo)的容器(qi)應蓋嚴(yan)，以(yi)防液體蒸(zheng)發(fa)。

雜(za)(za)交結(jie)束后，去除(chu)雜(za)(za)交液(ye)，立(li)即(ji)于室(shi)溫把濾膜放入大體積(ji)（300-500ml）的2×SSC和0.1% SDS溶液(ye)中，熒光原位雜(za)(za)交，輕輕振搖(yao)5分(fen)鐘，并將濾膜至少翻轉一次。重復洗(xi) 一次，同(tong)時應避(bi)免(mian)膜干涸。

68℃用300-500ml 1×SSC和0.1% SDS溶液洗膜兩次，每次1-1.5小時。此時已可進行自顯影。如背景很高或實驗要求嚴格的洗膜條件，可用300-500ml 0.2×SSC和0.1% SDS的溶液于68℃將濾膜浸泡60分鐘。