亞細(xi)胞(bao)定(ding)位是查找(zhao)生(sheng)物大分子在(zai)細(xi)胞(bao)內(nei)的具體(ti)存在(zai)的位置，如(ru)在(zai)核內(nei)、胞(bao)質內(nei)或者細(xi)胞(bao)膜上(shang)存在(zai)。常見的亞細(xi)胞(bao)定(ding)位方(fang)法有生(sheng)物信息學預(yu)測(ce)法、熒光(guang)法、GFP融(rong)合蛋白表(biao)達法。

熒光顯微(wei)鏡技術是一(yi)種非常有用的(de)工(gong)具，湖北(bei)亞(ya)細(xi)(xi)(xi)胞定(ding)位，可以幫助我們(men)了(le)解植(zhi)物(wu)細(xi)(xi)(xi)胞中不(bu)同細(xi)(xi)(xi)胞器的(de)位置和功能。通過使用不(bu)同的(de)標記物(wu)，我們(men)可以定(ding)位許(xu)多其他(ta)細(xi)(xi)(xi)胞器，亞(ya)細(xi)(xi)(xi)胞定(ding)位服務，例如核糖體、囊泡和細(xi)(xi)(xi)胞壁。這些信息(xi)對(dui)于研究植(zhi)物(wu)細(xi)(xi)(xi)胞的(de)生物(wu)學過程和開發新的(de)農業技術都非常重(zhong)要。

蛋白質序列特征：

利用改進(jin)型偽氨基酸組成法(fa)（PseAAC）、偽位置特(te)異性得(de)(de)分矩陣法(fa)（PsePSSM）和三聯(lian)體編碼(ma)法(fa)（CT）對(dui)蛋(dan)白(bai)質(zhi)序(xu)列進(jin)行(xing)(xing)特(te)征(zheng)提取，洋蔥亞細胞定位，并將(jiang)這三種方(fang)法(fa)得(de)(de)到(dao)的(de)(de)(de)(de)特(te)征(zheng)向(xiang)量進(jin)行(xing)(xing)融合，以得(de)(de)到(dao)一個(ge)全(quan)新的(de)(de)(de)(de)蛋(dan)白(bai)質(zhi)序(xu)列特(te)征(zheng)表達(da)模型，然后輸入到(dao)堆棧(zhan)式降噪(zao)自編碼(ma)器（SDAE）深度(du)網絡里自動學習更有效的(de)(de)(de)(de)特(te)征(zheng)表示(shi)，選用 Softmax 回歸(gui)分類(lei)器進(jin)行(xing)(xing)亞細胞的(de)(de)(de)(de)分類(lei)預(yu)測，可有效提高(gao)蛋(dan)白(bai)質(zhi)亞細胞定位預(yu)測的(de)(de)(de)(de)準確性。

利用 PSI-BLAST 工具搜索蛋白質序列，提取位點特異性譜中的位點特異性得分矩陣作為蛋白質的一類特征，并計算 4 等分序列的氨基酸含量以及 1～7 階二肽含量作為另外兩類特征，由這三類特征一共得到蛋白質序列的 12 個特征向量。通過設計一個簡單加權函數對各類特征向量加權處理，作為神經網絡預測器的輸入，可提高蛋白質亞細胞定位預測的精度。

GFP是綠色熒光(guang)蛋(dan)(dan)白，在(zai)掃(sao)描共聚焦顯微鏡(jing)的(de)激光(guang)照射下(xia)會發出綠色熒光(guang)，從而可以地定位蛋(dan)(dan)白質的(de)位置。綠色螢光(guang)蛋(dan)(dan)白（GFP）是一個由約(yue)238個氨基酸組(zu)成(cheng)的(de)蛋(dan)(dan)白質，從藍(lan)光(guang)到紫外線都能(neng)使其激發，發出綠色熒光(guang)。通過基因工程(cheng)技術，綠色螢光(guang)蛋(dan)(dan)白(GFP)基因能(neng)轉進不同物種的(de)基因組(zu)，在(zai)后代中持(chi)續表(biao)達，亞細(xi)胞定位方法，并且能(neng)根據啟動子(zi)特異性地表(biao)達。

使用GFP必須構建融合蛋白載體，并在轉染之后有效表達。這樣，若在熒光顯微鏡下看到細胞內某一部位存在GFP信號，說明和GFP融合的蛋白也存在于該部位，這樣就達到了確定某物質亞細胞定位的目的。