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洋(yang)蔥(cong)亞(ya)細(xi)胞(bao)(bao)定(ding)位(wei)(wei) 如(ru)何定(ding)位(wei)(wei)重要(yao)細(xi)胞(bao)(bao)器 亞(ya)細(xi)胞(bao)(bao)定(ding)位(wei)(wei)辦(ban)法就是用來肯(ken)定(ding)細(xi)胞(bao)(bao)內分子(zi)在細(xi)胞(bao)(bao)中的(de)位(wei)(wei)置的(de)一(yi)種辦(ban)法。如(ru)何使用熒光顯微(wei)鏡技術來定(ding)位(wei)(wei)洋(yang)蔥(cong)細(xi)胞(bao)(bao)中的(de)一(yi)些重要(yao)細(xi)胞(bao)(bao)器。
植(zhi)物(wu)細(xi)胞是由(you)許多不(bu)同的(de)細(xi)胞器組成的(de),這些細(xi)胞器在細(xi)胞內(nei)扮(ban)演著不(bu)同的(de)角色。為了(le)研究這些細(xi)胞器的(de)功能(neng)和(he)位置,科學(xue)家(jia)們使(shi)用(yong)各(ge)種(zhong)(zhong)技(ji)(ji)術來(lai)對(dui)它(ta)們進行定位。其中(zhong)一種(zhong)(zhong)常(chang)用(yong)的(de)技(ji)(ji)術是熒(ying)光顯微鏡技(ji)(ji)術,它(ta)可以通過(guo)標記特定的(de)蛋白質或化(hua)合物(wu)來(lai)觀(guan)察(cha)它(ta)們在細(xi)胞內(nei)的(de)位置。
蛋白質序列特征:
利用改進(jin)(jin)型偽(wei)氨基酸(suan)組成(cheng)法(fa)(fa)(PseAAC)、偽(wei)位置特異性(xing)得分(fen)矩陣(zhen)法(fa)(fa)(PsePSSM)和三聯體(ti)編(bian)碼法(fa)(fa)(CT)對(dui)蛋(dan)白(bai)質序列進(jin)(jin)行特征提取(qu),并(bing)將這三種(zhong)方法(fa)(fa)得到的(de)特征向(xiang)量進(jin)(jin)行融(rong)合,以(yi)得到一個(ge)全(quan)新的(de)蛋(dan)白(bai)質序列特征表達模型,然后輸入到堆棧式(shi)降噪自編(bian)碼器(qi)(SDAE)深(shen)度網(wang)絡里自動(dong)學習更(geng)有效的(de)特征表示,選用 Softmax 回歸分(fen)類器(qi)進(jin)(jin)行亞細胞(bao)的(de)分(fen)類預測(ce),可(ke)有效提高蛋(dan)白(bai)質亞細胞(bao)定位預測(ce)的(de)準確性(xing)。
利用 PSI-BLAST 工具搜索蛋白質序列,提取位點特異性譜中的位點特異性得分矩陣作為蛋白質的一類特征,并計算 4 等分序列的氨基酸含量以及 1~7 階二肽含量作為另外兩類特征,由這三類特征一共得到蛋白質序列的 12 個特征向量。通過設計一個簡單加權函數對各類特征向量加權處理,FISH,作為神經網絡預測器的輸入,可提高蛋白質亞細胞定位預測的精度。
雙分子(zi)熒光(guang)互補技(ji)(ji)(ji)(ji)術(shu)是(shi)一種在生(sheng)物學領域(yu)中廣泛(fan)應(ying)用的(de)實驗技(ji)(ji)(ji)(ji)術(shu)。該(gai)技(ji)(ji)(ji)(ji)術(shu)利用熒光(guang)標記的(de)兩個分子(zi),通過熒光(guang)共振能量轉移(FRET)原理,檢測兩個分子(zi)之(zhi)間的(de)相互作用。下面將詳細介(jie)紹雙分子(zi)熒光(guang)互補技(ji)(ji)(ji)(ji)術(shu)的(de)原理、實驗步(bu)驟、應(ying)用和發(fa)展趨勢。
雙分子熒(ying)光(guang)互補技術的原理
雙分子熒光互補技術是基于熒光共振能量轉移(FRET)原理的。當兩個熒光基團在一個緊密的空間內相互靠近時,一個熒光基團發射的熒光能量會被另一個基團吸收,導致第二個基團也發射熒光。這種熒光能量轉移現象稱為熒光共振能量轉移。通過檢測兩個熒光基團之間的能量轉移效率,可以推斷出兩個分子之間的距離和相互作用情況。
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